第一章：马可斯的崛起

合金弹头的故事发生在20世纪90年代，新世界军是一个迅速崛起的邪恶组织，他们的目标是征服世界。在第一部合金弹头中，马可·罗西和塔尔玛·罗维奇组成的正规军被派去阻止新世界军。

马可和塔尔玛穿越了被战争蹂躏的战区，对抗了新世界军的机械化部队、变异生物和巨大的BOSS。最终，他们到达了新世界军的总部，并与组织首领莫丁将军及其强悍的战斗机器人战斗。经过一场艰苦的战斗，马可和塔尔玛击败了莫丁，摧毁了新世界军的总部。

第二章：外星人入侵

在合金弹头2中，外星人种群Mars People入侵地球。这支有着先进技术的军队在全球范围内发起攻击，正规军再次被派去抵御入侵。

马可和塔尔玛与新成员菲欧·杰拉尔德一起，穿越了外星人的基地和飞船。他们遇到了各种各样具有挑战性的敌人，包括致命的机器人、巨型外星人，甚至还有身形庞大的外星首领。最终，他们到达了外星人的母舰，并击败了外星人女王。

第三章：金属弹头回归

在合金弹头3中，新世界军卷土重来，这次他们拥有了一种强大的新型武器，称为金属弹头。这种步行坦克有着毁灭性的力量，正规军必须设法阻止它落入新世界军手中。

马可、塔尔玛和菲欧在这次任务中得到了两位新成员的支持：里奥·海沃德和南希·哈特菲尔德。他们一起穿越了新世界军的基地和废弃城市，与各种敌人作战。最终，他们到达了新世界军的总部，并在那里与莫丁将军及其新金属弹头战斗。

第四章：叛乱与救赎

在合金弹头4中，正规军发生了一场叛乱。一个名为“正规军叛徒军”的组织由前将军阿伯·威克斯领导，他们对正规军的高层领导发动了一场政变。

马可、塔尔玛和菲欧被指控为叛徒，并被正规军追捕。他们必须找到一种方法来清除自己的名字，并阻止叛徒军控制正规军。在这次任务中，他们遇到了两位新成员：艾里卡·卡辛顿和哈维克·帕克。他们一起穿越了叛徒军控制的地区，对抗了叛徒军士兵、变异生物和强大的BOSS。

第五章：时间的终结

在合金弹头5中，新世界军通过打开一个时空虫洞将过去的敌人带到了现在。马可、塔尔玛、菲欧、艾里卡和哈维克必须穿越不同的时代，对抗来自不同时期的敌人，以阻止新世界军的阴谋。

他们穿越了原始时代、中世纪、未来，与各种各样具有挑战性的敌人作战。最终，他们到达了新世界军在时空虫洞中的基地，并在那里与莫丁将军及其新的终极武器战斗。